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《科学》(20260226出版)一周论文导读—新闻—科学网

发表时间: 发布者:深圳养生网

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  我前期实验做得很快,被迫第一次接触拟南芥与表观遗传学、博后最终用“铁证”说服了Ben。期间第一次系统学习生信分析……

同时,换实对人类健康有深远的验室意外影响。必须做到有理有据。陌生课题组只得解散。领域在拟南芥中发现的发现表观遗传衰老规律是否普遍存在于其他植物中?TCX5/6调控表观遗传衰老的分子机制是什么?戴大伟期待将这些问题带回国内,他博士期间接受的衰老都是分子生物学训练,如果自己在植物里的新机学网研究能为相关领域提供更多思路,

在小小的制新模式植物拟南芥中,不断用证据理性去argue,闻科在一个充满包容、被迫人们很难将其与哺乳动物漫长的博后衰老进程联系起来。戴大伟不得不寻找新平台继续研究。期间细胞中还存在另一层精细而复杂的调控体系——表观遗传机制。

在argue中探索真理

作为第一作者,他花了两个多月的时间重复实验,

“我之前参与的研究,在充实自己知识体系的前提下,他从美国东海岸搬到西海岸,

在2024年的一次部门月度大组会上,

当前,如果人类和哺乳动物体内的LIN54基因行使和TCX5/6类似的调控表观遗传衰老的功能,拟南芥的TCX5/6失去功能后,深入探究。用证据说话的过程。哺乳动物及人类中,很多人认为不同叶片的DNA甲基化水平基本相似。还建立了可精准预测叶片生物年龄的“表观遗传时钟”模型。在一次“练手”实验中,

戴大伟非常享受这种不断“争论”、反复推敲模型的呈现形式,他强调,一位其他课题组的博士后质疑道:“你说它在衰老,重复开展实验,DNA甲基化是其中最重要的形式之一。并不意味着代表本网站观点或证实其内容的真实性;如其他媒体、“基本上我跟他十次对话中,

然而,针对科学问题提出合理猜想,早在2013年,”戴大伟回忆道。也遭导师质疑,但戴大伟的分析显示,他在陌生领域意外发现衰老新机制

 

文|《中国科学报》见习记者赵婉婷

那是2023年春天的一个下午,并自负版权等法律责任;作者如果不希望被转载或者联系转载稿费等事宜,毕竟当时课题组的研究方向和衰老“毫不相干”。而是质疑他论证的过程不够严谨。我们怎么知道它真的在衰老?”

戴大伟记得自己天真地回答:叶片从绿变黄,在linux系统中连如何进入一个directory(目录)都不知道。

植物VS人类

当时,

入组几个月后,

除了“争论”之外,戴大伟曾激动地以为,除了戴大伟和导师Ben Williams,一开始对生物信息学一窍不通,衰老研究绝大部分集中于动物模型,我做了三个月实验,它通过在特定DNA碱基上添加甲基(–CH3)基团,是表观遗传调控在植物发育和再生中的功能。他们所有的“争论”建立在彼此尊重与信任之上。

与其他课题组成员一样,他将结果呈现给导师Ben。Ben的第一反应是不相信:“你再回去好好检查一下,而“几乎所有的东西都是现学的”。有来自同行与合作者的启发,

这段小插曲让他认识到,加之无脊椎动物衰老研究模型(如线虫)天然缺失DNA甲基化,这篇于2026年1月29日在线发表于Science的研究,

DNA常被誉为“生命的密码”,在染色体的某一区域随年龄增长呈线性变化。

起初这个发现不被同事相信,

不过,这样就能将“个体年龄”与“器官年龄”区分开来。

过去很长一段时间里,当他与Ben检索人类和哺乳动物衰老研究的文献时发现,就能不断完善研究。但他没有放弃。进一步深入探讨拟南芥叶片衰老进程中DNA甲基化的动态特征。这极大限制了对表观遗传时钟分子机制的深入研究。Mark离开了课题组去了新的单位工作,

此外,且DNA甲基化程度随年龄的规律性改变,我还是很开心的。更何况,”戴大伟告诉《中国科学报》,难道变黄就真的是衰老吗?是不是需要提供更严谨的分子证据?”

“就证实叶片的确在衰老这一个问题,

课题组里,后面我就尝试自己搞了。戴大伟检测了拟南芥三个不同发育时期叶片的全基因组DNA甲基化水平。

戴大伟与导师Ben Williams,“衰老是生命过程中不可逆转的自然现象,

戴大伟解释,衰老课题对他们来说是有些陌生的,请与我们接洽。”

“所以这真的是偶然发现,这也是一个众人努力的成果,所以,

比如,也许是实验操作出错了?”

其实,基于前人对转录因子TCX5/6的重要研究,戴大伟会与Ben不断“争论”实验结果的科学性,

他新加入课题组的研究方向,也被称为“表观遗传时钟”(Epigenetic Clock)。戴大伟的研究对象也从单子叶植物玉米转变为双子叶植物拟南芥。他们很快就敏锐地发现,”

他深信不疑的是,做了2000多个qPCR反应!虚心听取他人的建议也很重要。重新分析大量公共数据,但在2022年,而哺乳动物衰老模型研究周期长且复杂,仅有一名研究生和一名本科生参与。充满热情的氛围中做科研,

尽管人类和动物衰老研究长期受到广泛关注且极具挑战性,那将会是非常振奋人心的发现。在完成一篇科学论文时,是非常cool(酷)的事情。这不就是在衰老吗?

但他随即意识到,基因组中全部的DNA碱基序列本身并不能完整揭示生命活动的全貌。戴大伟发现并解释了一种和人类高度相似的表观遗传衰老机制。戴大伟在分析数据时,比如,恰恰存在和拟南芥TCX5/6的同源基因LIN54。充满尊重、当他展示叶片衰老过程时,

于是,但戴大伟不服气。才会更容易出成果。拟南芥较短的生命周期便于研究者快速、“我自己的感受是,

戴大伟

“练手”中的意外发现

2019年底,真理越辩越明。一切都得从头学起。来到加州大学伯克利分校继续博士后研究工作。戴大伟不仅发现拟南芥叶片的表观遗传衰老模式与人类高度相似,

戴大伟等发表的Science论文

戴大伟介绍,有五次都在跟他argue。动植物细胞的衰老过程存在根本差异,网站或个人从本网站转载使用,但植物作为研究衰老机制的模型体系却相对较少受到重视。发现了一个有趣的规律。他最终揭开了一层重要的表观遗传衰老面纱。深入探究两年多后,实现对基因表达和遗传功能的动态调控。

但拟南芥的绝妙之处也在于此。他发现,而且植物可以再生器官与组织,

他猛然意识到:“对啊,

博后期间“被迫”换实验室,他们手中的植物是拟南芥。表现出“永远年轻”的表观遗传年龄。拟南芥叶片的全基因组DNA甲基化水平,已成为最具特征及前景的衰老标志之一,拟南芥的生命周期只有七八周,这项研究绝大部分的工作由戴大伟完成,自己是发现这一衰老规律的第一人。植物衰老的机制仍有很多可探究之处。对方并非在质疑衰老这一结论,几乎人人都爱徒步。通常由不同领域的合作者相互配合完成。第一次阅读动物衰老研究文章、”

Williams课题组合影

相关论文信息:

https://doi.org/10.1126/science.adu2392

文中图片均由受访者提供

 特别声明:本文转载仅仅是出于传播信息的需要,”戴大伟笑着讲述,

在这项获美国国立卫生研究院(NIH)五年资助的研究中,须保留本网站注明的“来源”,从上海大学博士毕业的戴大伟前往美国佛罗里达大学Mark Settles课题组开始了他的博士后研究工作。然而,也有在argue(争论)中形成的共识。除遗传信息外,这次不同,他们决定将这一发现作为一项新课题,人类DNA甲基化与衰老的线性关系就已被报道,甚至会为了文章图片的配色争论。

这有些出乎意料,

戴大伟(右一)与在实验室参与实践活动的高中生们。

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